這部影片是《怪獸公司》前傳,情節設定在第一集的10年前。講述毛怪與大眼仔大學時期生活情況。有點類似《玩具總動員》中胡迪和巴斯光年的關系。整個劇情連貫,懸念一波接一波,仿佛性愛中使用aphdiic,讓人高潮叠起,意猶未盡。
故事從麥克華斯基(大眼仔)小時候的戶外教學開始,他參訪怪獸公司時,受到一位來自怪獸大學驚嚇專員的鼓勵,大眼仔也從此下定決心總有一天一定要成爲一位驚嚇專員。
故事又推進到大眼仔上怪獸大學之後的故事,終于成爲怪獸大學的學生之後,進了驚嚇學院,在宿舍的房間認識了自己的室友-藍道,兩人後來成爲好朋友,在課業上彼此互相幫助,玩樂也是在一起玩耍。大眼仔在後來便開始爲將來能夠成爲驚嚇專員而努力,不久後他認識了詹姆士 ·蘇利文(毛怪),毛怪他父親是一位專業的驚嚇專員因此有不少的知名度,也因此加入了菁嚇會(Roar Omega Roar)(由驚嚇課程中的菁英所組成的兄弟會),但他對課業卻不怎麽認真,也喜歡惡作劇,兩人也因此陷入了瘋狂的競爭。
到了學生都要通過驚嚇學院郝刻薄院長的期末考時,大眼仔和毛怪在彼此的爭鬥當中不小心弄壞郝刻薄院長的終生成就驚嚇電力瓶,雖然郝刻薄院長沒有對這件事情感到憤怒,但卻認爲大眼仔和毛怪都沒有學習驚嚇的資格而不讓他們學驚嚇課程,毛怪也因此被菁嚇會會員踢出會,而對大眼仔懷恨在心。
大眼仔加入了怪獸大學最爛的萬事OK社(Oozma Kappa),參加學校所舉辦的怪獸驚嚇杯大賽,並跟郝刻薄教授賭如果萬事OK社贏了,就要讓大眼仔重返驚嚇課程,要不然就退學。在報名截止日當天報名時本來人數不夠無法參加,原本想找因爲遲到而湊巧出現在大眼仔眼前的藍道加入,然而藍道卻早已經是菁嚇會的會員了,結果最後是毛怪加入,使萬事OK社可以參加比賽,至此,藍道和大眼仔的一段時間以來的友情正式結束。本來在第一關卡就出局的萬事OK社由于怒吼社(Jaws Theta Chi)使用違規藥物參加比賽被取消資格而奇迹晉級,大眼仔和毛怪也因此了解到要彼此互相幫助才可以度過難關,因此大眼仔教導萬事OK社的人如何運用自己的能力突破難關,也讓其他的兄弟會刮目相看。菁嚇會邀請他們參加兄弟會派對,但也借此侮辱萬事OK社的人,這此舉動讓大眼仔帶領萬事OK社的人偷偷溜進怪獸公司,並讓他們看專業的驚嚇專員是如何嚇人的,大眼仔和毛怪也開始培養深刻的友誼,不料被怪獸公司的警衛發現,倉惶逃出後,大家開始認真起來,陸續的比賽,最後終于要跟菁嚇會進行最後總決賽的前一晚,毛怪向郝刻薄院長表示如果他和大眼仔回到驚嚇學院,希望她不要記仇,但郝刻薄院長反問毛怪他到底認不認爲大眼仔是否有能力嚇人。
到了總決賽,比賽項目是模擬嚇人,而且設定難度非常高,依電量瓶的能量進行評分,在倒數第2場比賽中,毛怪對上藍道,毛怪因爲非常凶猛的吼叫聲影響到藍道的比賽成績,還讓藍道的身體保護色呈現有紅色愛心形狀外加白色的底色,藍道也因此遭到嘲笑和責罵,此時的藍道便發誓要擊敗毛怪,藍道和毛怪也因此結下梁子,爲後來的藍道將毛怪視爲勁敵的事情埋下種子。當萬事OK社跟菁嚇會平手時,換到最後一位大眼仔,大眼仔竟然輕松突破記錄,幫萬事OK社拿下冠軍,之後大眼仔發現有人在驚嚇模擬器上動手腳,把他的設定難度調到最低,毛怪最後也承認他因爲怕大眼仔沒有能力去嚇人而在模擬器動手腳,最後大眼仔非常傷心又憤怒的離開,萬事OK社的成員也把獎杯扔在一旁。毛怪也因此非常自責,並向郝刻薄院長承認作弊,表明自己承擔責任,不料這時大眼仔闖入了驚嚇門研究室,想要挑戰連郝刻薄院長都束手無策的門,但反而被困在裏面,毛怪也進入了門裏面,找到大眼仔,大眼仔對自己沒辦法嚇人而感到非常傷心,而毛怪也訴說自己其實也是很害怕嚇人,不料兩人快要被人類發現想逃回怪獸世界時,發現門通往怪獸世界的通道被郝刻薄院長關閉了,因此大眼仔就想到利用人類尖叫聲來重新啓動門的電源(如果有看怪獸公司的人應該就會知道此原理),在兩人的協力下,成功嚇倒要搜索他們的人,尖叫聲所産生的電力強到把郝刻薄院長身旁全數的電量瓶給充爆,兩人也成功逃出,然而學校辛苦研究的門被炸毀了,郝刻薄院長被他們所做的事情震驚不已,然而兩人也最後被退學了。
要離開前夕,萬事OK社感謝大眼仔所做的一切,因爲他萬事OK社的成員得以參加下學期的驚嚇課程,就在毛怪和大眼仔離開時,郝刻薄院長表示毛怪和大眼仔是首次讓她出乎意料的學生,並祝福他們兩人一路順風,最後兩人提早加入怪獸公司,先從分信員做起,他們成爲驚嚇專員的道路就此開始。