本劇的導演袁祥仁是香港著名的\\\"和平電影公司\\\"的檯柱子，他作為武術導演，指導過的電影《新龍門客棧》以及電視劇《水滸》、《太极宗師》等都在國內產生很大的影響。這次由他的\\\"袁傢班\\\"來指導古裝武打劇《南少林》，他獨特的設計和精綵的絕活，勢必迴贏得廣大觀眾訢賞和喜歡。
雍正年間，閩粵地區形勢動蕩，\\\"天鷹帮\\\"斂鉅資廣納武林人士，為朝廷一大腹患。南少林也被吸納其中。雍正決定派他最得意的兩位皇子--三阿哥弘時、四阿哥弘歷，一文一武、一明一暗兵分兩路趕赴南少林，查辦天鷹帮一事。雍正命兩位皇阿哥齣馬，意在攷察此二人誰可擔當國傢大任，繼承帝业。而兩位皇子更是機敏過人，深明雍正之用意。二人為取悅龍顏，呈功於雍正，便使齣渾身解數查辦天鷹帮與南少林。在此過程中，心狠手辣的弘時視弘歷為眼中釘，多次派人暗下毒手，索取弘歷性命，以除心頭之患。
俠肝義膽的南少林俗傢弟子方世玉齣手相助，帮弘歷逃過一次次劫難和迫害。二人遂結為好友。
而弘時在泉州暗中網羅閩浙總督張信德與其手下，結黨營私。他以查辦天鷹帮為名，大開殺戒，鏟除異己。南少林的玄通方丈被其所迫害緻死。弘時從此將自己送上不歸路。方世玉也從此視弘時為不共戴天死敵。
弘歷在查辦天鷹帮的過程中，因有方世玉、洪熙官、俠盜趙大宏、江湖老韆卓靈仗義相助，得以化解重重阻難，並漸漸查明弘時和張信德相互勾結的種種陰謀詭計。弘歷也髮現方世玉之父方德隻是天地會手中的一顆棋子，而天地會因作為天地會名譽堂主之一的方德已無利用價值就對其下毒手，此時方世玉為救其父，冒著九死一生的危險殺齣南少林之木人巷，從法場劫走方德。弘歷被方世玉與方德之間真挚的父子之情而打動，網開一麵，允許方德隱居荒島，從此遠離世事。
同時李夢麟得知弘歷迺當朝皇子的真實身份，陷入艱難的抉擇之中。而弘歷也得知他的心上人李夢麟就是天鷹帮的\\\"特使\\\"，亦使弘歷陷入深深的痛苦之中。李夢麟天真的以為將父親早先釦留的財物獻於天地會能免於一死從而與弘歷在一起，卻被師傅認為是叛徒而滅口，她用自己得生命捍衛了她與弘歷之間的這段真情，也將自己從痛苦中解脫齣來。
在\\\"天鷹帮\\\"之事水落石齣之際，由於南少林難脫其咎。弘歷決定火燒南少林，此時，方世玉誓言無論怎樣都將與南少林生死與共。就這樣，一對情同手足的兄弟，對峙於南少林山門之下……
最後，方世玉和弘歷聯手粉碎了弘時和張信德勾結倭寇竊取南少林鎮寺之寶的企圖，並粉碎了敵人分裂祖國、破壞民族團結的陰謀。
本劇是描寫少林和尚方世玉從一個天真浪漫的少年成長為一個民族英雄的感人故事。
錶現了方世玉的聰敏機變，神勇無敵。歌頌了他愛憎分明，深明大義，為維護祖國統一、安定和平，前僕後繼不怕犧牲的民族主義精神和愛國主義精神，也歌頌了他和卓靈、張小瑩之間純真美好的愛情。
