自稱美食偵探的謎樣男子高野聖也在2006 年解決了很多疑案後神秘地消失了，他花了半年的時間周遊世界品嘗美食兼帶破案。某日在意大利接到了兩個小孩轉交的一封裝有折扣券的信封後回到日本橫濱。重回福爾摩斯偵探所的高野聖也發現已經人去屋空。紅月拉面店的店長被人殺害，警方懷疑是紅月的競爭對手為了偷取湯頭的秘方才痛下殺手。高野聖陸續找到金田一、野田涼介和出水京子，不料大家都因為高野聖也不辭而別非常生氣，大家都已經開始了各自的生活。就在聖也弄明白了紅月的秘方後卻被人劫持，原來紅月的老板是被批發過期豬骨的不法商犯殺害的，最終在金田一緒方桃等人的幫助下高野聖也和涼介死裏逃生，橫濱福爾摩斯偵探所重新結集……
